就所有古代文明而言，一些工艺最为精湛的石块结构源自印加建筑。从外立面上看，印加建筑几乎始终兼具实用功能和审美效果。其设计风格也极为统一，即便是那些宏伟的皇家建筑，外观也与那些较为简陋的建筑相似，唯一显著的区别在于前者规模更大，装饰工艺更精湛。
印加建筑在诸多方面都热衷于体现二元性，其一大显著特征在于，它们通常既能巧妙地融入自然景观，同时又能合理地驾驭周边环境，从而营造出建筑几何形态与自然生态样貌交相辉映的恢宏盛景。
材料
石材是印加人首选的建筑用料，经过工匠们的精心打磨砌筑，那些精准排列的、彼此无缝衔接的石墙支撑起一幢幢精美的建筑。石材有三种类型：尤卡石灰岩、绿色萨克塞华曼闪长斑岩和黑色安山岩。每块石头或重达数吨，开采和塑形需要使用更硬的石材和青铜工具。石块上遗留的痕迹表明，它们大多是被捶打成形，而不是被切割成形。石块的搬运则需要用到绳索、圆木、杆子、杠杆和借助坡道，一些石块上用于帮助搬运工控制石块移动方向的凹凸处以及移动摩擦留下的划痕依稀可见。现场对石块的切割和砌筑非常精准，因此无需使用砂浆。按照惯例，最后一道工序是工匠们使用磨石和沙子来精细打磨石墙的外立面。
在采石场和通往建筑工地的各条道路上留下的未完成的石料清楚地表明，石料首先在采石场被粗略地加工，然后在最终目的地被二次加工。工匠们将石块安放入位调试，不吻合处重新打磨塑形，然后再次入位调试，直到各种形状的石块天衣无缝地咬合在一起。这一过程既要求万分精细，同时又耗时很长，但实验表明，它仍比学者们之前想象的要快得多。即便如此，建造一堵精美的石墙也需要耗时数月。无缝衔接的石块和稍微内倾的墙壁使印加建筑具有极强的抗震能力，500年来的多次地震对印加建筑几乎没有造成什么破坏，绝大部分基本保存完好，当然，极个别的损伤在所难免。
较为简陋的建筑采用未经加工的田间石块，用泥灰浆砌成；在气候较为干燥的地区，则使用干泥砖（土坯）。这两种建筑通常都涂抹一层泥浆或泥灰，然后再涂上鲜艳的色彩。例如，普卡坦普（Puka Tampu）的墙壁上仍留有红、黑、黄、白颜料的痕迹。
屋顶通常由固定在木杆或藤条上的茅草或芦苇铺就，这些杆子用绳索捆在一起，并通过从石墙上突出的石钉固定在石墙上。这些石钉可以嵌入墙体，也可以由其中一块石头打磨而成，它们有的是圆形的，有的是方形的；有时，个别石钉还会出现在内墙表面作为挂钉使用，可能用于悬挂墙饰织物；另外，有时山墙顶部会安装一个石环，同样用于固定屋顶；在降雨较多的地区，屋顶的坡度会更陡，通常为60度。
特色
绝大多数印加建筑都是长方形的、只有一个出入口的单间房屋，因为隔墙在印加设计中并不常见。有一些罕见的多门长方形建筑的例子，甚至还有圆形或 U 形的建筑，但常见的还是直墙结构。另外，大多数建筑只有一层，但也会有两层的建筑，尤其是那些依山而建的建筑以及首都库斯科那些更为宏伟的皇家建筑，有时甚至还有三层的建筑。
印加建筑外墙一般向内倾斜（一般在 5 度左右），使建筑呈现出独特的梯形形状。梯形形状在帝国的北部和中部更为常见，其视觉效果之一是使墙壁看起来比实际更大更厚。梯形图案在门廊、窗户和室内壁龛中会重复出现。门廊和窗户通常也有双侧柱，门廊顶部通常放置一整根儿大块石楣。
首都的建筑和遍布帝国的皇家建筑在设计上与其他较为普通的建筑非常相似。当然，它们的规模通常要大得多，而且石雕的质量也高得多。有些建筑，采用了更具野心的设计，比如砌筑弧形墙壁，采用更奢华的装饰，例如使用纯金贴板等，就像库斯科的圣地科里坎查区一样，它的弧形墙壁部分至今仍基本保存完好。皇家宫殿与寻常巷陌在建筑风格上既形似而又神不同的二元性是印加文化的一大特色。
印加建筑的基本设计原则可能比较统一，似乎缺乏个性，但历史记录中却留存了几位建筑师的名字，如 Huallpa Rimichi Inca、Inca Maricanchi、Acahuana、Sinchi Roca 和 Calla Cunchuy，这表明当时的建筑设计允许有一定的个性。
结构
矩形建筑群可以是三栋建筑（或更多）组成一组，并围绕着开放的、带有围墙的庭院或天井排列，这也许是印加建筑最常见的布局。这种小型建筑群被称为“kancha”，其功能包括行政大楼、车间、寺庙、住宿或上述功能的混合体。那些非常大的建筑被称为 kallanka，这种建筑通常有多扇门，面向一个很大的开放空间，通常（再次）呈梯形布局。它们可能用于公众集会或作为印加政府代表的住所，并且明显是帝国控制全局的公共象征。宫殿的设计与小型建筑相似，只是规模更大，石雕更精细，通常设有围墙，以限制闲杂人等的进入和围观皇室成员。
每个主要的印加定居点都有一个乌什努 (ushnu)，象征着印加国王对整个帝国的统治。乌什努是举办游行、国家重要仪式和司法程序的观景台，位于主广场的一侧。城市规划的另一个特点是设计建造巨大的城门，其中最令人印象深刻的一定是 Quispiguanca 的城门，它有两层塔楼和三重门框。
Collca（或 Qollqa）是印加仓库的通称，通常成组或成片建造。它们可以是圆形或矩形，但只有一个房间。这些仓库通常位于山坡上，这样既通风良好，又有遮荫，因此可以更好地保存容易腐烂的物品。砾石地板和排水沟有助于保持室内空气干燥，并确保谷物或土豆等货物存储两年或更长时间而不变质。
印加定居点很少设防，因为战争通常以定点清剿的形式进行，而且被征服民族的归顺多是通过政治、经济和文化手段而非军事手段来确保的。此外，建造帝国风格的建筑是殖民进程的一个重要组成部分。 然而，也存在例外情况。一些人认为马丘比丘是一处设防的遗址，而像奥扬泰坦博这样抵御西班牙人的最后的城堡式定居点，则是用巨大的石块砌成梯田式围墙进行防御的。
山坡上的梯田与建筑物一样，要么用泥浆固定松散的岩石，要么用精细切割的大块岩石，这样做可以扩大可耕种土地的面积，为农作物提供更好的给排水系统，但有时它们也只是装饰性的，比如种植鲜花点缀田间地头。皮萨克（Pisac）和欧雁台（Ollantaytambo）的梯田令人印象极为深刻，其设计具有明确且精心规划的美学效果。
就连岩石露出地表部分也被印加人雕琢成了实用的形状。例如，在萨克塞华曼，一座带有台阶的类似王座的形状的雕刻被凿刻在一座石山上。较小的岩石露头的部分被切割成几何形状或图案，比如锯齿形和矩形，但其确切用途尚不得而知。这类建筑还特意利用光影效果，为自然景观增添了几何维度。例如，萨克塞华曼的曲折城墙投射出三角形的阴影，仿佛与背景山峰投下的阴影相互映衬。人们还在岩石的天然裂缝中开凿出房间，其中最著名的是马丘比丘托雷翁（Torreón）塔下的太阳神因蒂神庙。
规划布局
城镇整体规划是印加建筑师考虑的重要方面。主要道路常常以一定角度穿过城镇，万奴科潘帕（Huánuco Pampa）就是一个很好的例子。城镇的整个区域通常与中央广场、乌什努（ushnu，一种祭祀台）和皇家住所对齐，而皇家住所通常朝向日出的方向；更普遍的规律是，印加建筑的长边通常与广场平行；建筑群从来都不是正方形的，而且由仅供行人通行的、狭窄笔直的交叉道路构成；有时，甚至整个城镇都有自己的轮廓象征，最著名的例子是库斯科的布局意图，从上方鸟瞰时，其轮廓很像美洲狮的外形。
印加建筑师的另一个重要考量是建筑物的方位选择和建筑物门窗的位置选择，目的是使居住者可以随时欣赏到大自然的美景，并且可以通过这些门窗观测到天体的运行和在重要节气（如冬至或夏至）时的星象和太阳。印加建筑的大门很少不考虑与周围环境的契合。
另一方面，印加建筑师始终追求建筑与周围自然环境完美融合的梦想。最著名的例子就是马丘比丘，它沿着山坡的轮廓建造，甚至将大石头等自然特征融入实际建筑中；有时，神圣的石头或建筑的轮廓甚至被设计成模仿自然景致的轮廓，例如远处的山脉；另外，墙壁与其底部岩石无缝衔接的著名案列是 Tambo Machay 的狩猎小屋和库斯科的 Sacsayhuaman 神圣堡垒遗址。这种整合的结果是有机物与几何造型的彼此嵌入融合，传达了一个明确的信息，即：正如统治者可以统领臣民一样，人类也可以敬仰但最终征服大自然。
